A Prefeitura realiza, anualmente, os Jogos Escolares das Unidades Municipais de Educação de Santos (Jeumes) e os Parajogos Escolares das Unidades Municipais de Educação de Santos (Parajeumes), importantes eventos esportivos da rede de ensino. Essas competições, retomadas em maio de 2016, visam promover o intercâmbio social e esportivo entre as escolas, fomentar a prática de diversas modalidades e incentivar atitudes solidárias, cooperativas e de respeito mútuo, reforçando a cultura da paz. Na última edição, em 2019, participaram 2 mil alunos de 41 escolas de ensino fundamental, competindo em atletismo, futsal, basquete, handebol, tênis de mesa, xadrez e lutas.

Outra tradição consolidada no calendário escolar é o Festival Internúcleos de Lutas, criado em 2014, e destinado aos núcleos do programa Escola Total e às unidades de período integral, do 1º ao 9º ano. As modalidades incluem taekwondo, capoeira, judô e caratê. Na edição mais recente, também realizada em 2019, 400 alunos participaram representando as unidades Dos Andradas II, Mário de Almeida Alcântara, Avelino da Paz Vieira, Santista, Padre Waldemar Valle Martins e os núcleos do programa Escola Total/Jornada Ampliada: Marina Magalhães, Caruara, Monte Cabrão, Ponta da Praia, Centro Cultural da Zona Noroeste, Vila Criativa e Cais Milton Teixeira.

O Festival Internúcleos de Lutas foi organizado pela Secretaria de Educação (Seduc) nos dois primeiros anos e, a partir de 2016, passou a ser desenvolvido pelos Núcleos da Jornada Ampliada, reforçando o compromisso com o esporte e a formação cidadã dos alunos.